Molekulare Zelle – Forscher Ji Xiong, Universität Peking

Titel: Gezielter Proteinabbau enthüllt RNA-Pol-II-Heterogenität und funktionelle Diversität

Zusammenfassung: Es wird angenommen, dass Untereinheiten der RNA-Polymerase II (RNA Pol II) an verschiedenen transkriptionsassoziierten Prozessen beteiligt sind. Es ist jedoch unklar, ob sie unterschiedliche regulatorische Rollen bei der Modulation der Genexpression spielen. Hier führten wir eine Sequenzierung entstehender und reifer Transkripte nach dem akuten Abbau von 12 RNA-Pol-II-Untereinheiten von Säugetieren durch und profilierten ihre genomischen Bindungsstellen und Proteininteraktome, um ihre molekularen Funktionen zu analysieren. Wir fanden heraus, dass RNA-Pol-II-Untereinheiten unterschiedlich zur zellulären Lokalisierung und Transkription von RNA-Pol-II beitragen und bevorzugt die RNA-Verarbeitung regulieren (z. B. RNA-Spleißen und 3′-Endreifung). Gene, die empfindlich auf die Depletion verschiedener RNA-Pol-II-Untereinheiten reagieren, neigen dazu, an verschiedenen biologischen Funktionen beteiligt zu sein und unterschiedliche RNA-Halbwertszeiten zu zeigen. Sequenzen, assoziierte Proteinfaktoren und RNA-Strukturen korrelieren mit der durch die RNA-Pol-II-Untereinheit vermittelten differentiellen Genexpression. Diese Ergebnisse legen insgesamt nahe, dass die Heterogenität von RNA Pol II und verschiedenen Genen offenbar von einigen Untereinheiten abhängt.